Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ESRRAP11474 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ESRRAP11474 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms