Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGAMP11215 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGAMP11215 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms