Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARBP10826 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARBP10826 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARBP10826 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RARBP10826 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RARBP10826 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RARBP10826 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARBP10826 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARBP10826 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARBP10826 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARBP10826 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARBP10826 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARBP10826 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RARBP10826 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARBP10826 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RARBP10826 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARBP10826 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RARBP10826 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARBP10826 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARBP10826 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARBP10826 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARBP10826 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARBP10826 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARBP10826 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARBP10826 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARBP10826 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARBP10826 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RARBP10826 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARBP10826 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARBP10826 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARBP10826 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARBP10826 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARBP10826 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARBP10826 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RARBP10826 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARBP10826 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARBP10826 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARBP10826 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARBP10826 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARBP10826 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARBP10826 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARBP10826 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARBP10826 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARBP10826 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARBP10826 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARBP10826 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARBP10826 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RARBP10826 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARBP10826 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARBP10826 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RARBP10826 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARBP10826 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARBP10826 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARBP10826 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARBP10826 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARBP10826 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARBP10826 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARBP10826 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RARBP10826 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RARBP10826 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARBP10826 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARBP10826 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARBP10826 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARBP10826 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARBP10826 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RARBP10826 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARBP10826 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RARBP10826 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARBP10826 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARBP10826 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARBP10826 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARBP10826 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RARBP10826 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARBP10826 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARBP10826 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARBP10826 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARBP10826 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RARBP10826 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARBP10826 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARBP10826 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARBP10826 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RARBP10826 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RARBP10826 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RARBP10826 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RARBP10826 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RARBP10826 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RARBP10826 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RARBP10826 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RARBP10826 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RARBP10826 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RARBP10826 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RARBP10826 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RARBP10826 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RARBP10826 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RARBP10826 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RARBP10826 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RARBP10826 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RARBP10826 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RARBP10826 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RARBP10826 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms