Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM225BP0DP42 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms