Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RD3LP0DJH9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms