Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC159P0C7I6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC159P0C7I6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms