Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C4AP0C0L4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
C4AP0C0L4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms