Protein–RNA interactions for Protein: P08237

PFKM, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKMP08237 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PFKMP08237 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PFKMP08237 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PFKMP08237 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PFKMP08237 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PFKMP08237 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PFKMP08237 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PFKMP08237 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PFKMP08237 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PFKMP08237 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PFKMP08237 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PFKMP08237 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PFKMP08237 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PFKMP08237 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PFKMP08237 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PFKMP08237 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PFKMP08237 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PFKMP08237 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PFKMP08237 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PFKMP08237 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PFKMP08237 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PFKMP08237 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKMP08237 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKMP08237 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKMP08237 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKMP08237 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKMP08237 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKMP08237 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKMP08237 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKMP08237 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKMP08237 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKMP08237 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKMP08237 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKMP08237 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKMP08237 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKMP08237 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKMP08237 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PFKMP08237 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFKMP08237 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFKMP08237 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFKMP08237 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFKMP08237 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFKMP08237 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFKMP08237 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFKMP08237 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFKMP08237 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFKMP08237 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFKMP08237 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PFKMP08237 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PFKMP08237 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PFKMP08237 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFKMP08237 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFKMP08237 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFKMP08237 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFKMP08237 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFKMP08237 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFKMP08237 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFKMP08237 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PFKMP08237 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFKMP08237 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFKMP08237 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFKMP08237 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFKMP08237 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFKMP08237 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFKMP08237 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFKMP08237 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFKMP08237 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFKMP08237 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFKMP08237 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PFKMP08237 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFKMP08237 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFKMP08237 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFKMP08237 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFKMP08237 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFKMP08237 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFKMP08237 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFKMP08237 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFKMP08237 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PFKMP08237 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFKMP08237 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFKMP08237 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFKMP08237 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFKMP08237 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PFKMP08237 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFKMP08237 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFKMP08237 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFKMP08237 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFKMP08237 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFKMP08237 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFKMP08237 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PFKMP08237 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFKMP08237 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFKMP08237 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFKMP08237 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PFKMP08237 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFKMP08237 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFKMP08237 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PFKMP08237 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFKMP08237 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PFKMP08237 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms