Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSN3P07498 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSN3P07498 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSN3P07498 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSN3P07498 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSN3P07498 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSN3P07498 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSN3P07498 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSN3P07498 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSN3P07498 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSN3P07498 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSN3P07498 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSN3P07498 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSN3P07498 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSN3P07498 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSN3P07498 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSN3P07498 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSN3P07498 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSN3P07498 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSN3P07498 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSN3P07498 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSN3P07498 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSN3P07498 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSN3P07498 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CSN3P07498 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CSN3P07498 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CSN3P07498 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSN3P07498 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSN3P07498 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSN3P07498 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSN3P07498 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN3P07498 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN3P07498 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN3P07498 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN3P07498 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN3P07498 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN3P07498 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN3P07498 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN3P07498 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN3P07498 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN3P07498 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN3P07498 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN3P07498 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN3P07498 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSN3P07498 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSN3P07498 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSN3P07498 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSN3P07498 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSN3P07498 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSN3P07498 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSN3P07498 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN3P07498 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN3P07498 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN3P07498 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN3P07498 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN3P07498 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN3P07498 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN3P07498 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN3P07498 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN3P07498 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN3P07498 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN3P07498 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN3P07498 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN3P07498 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN3P07498 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN3P07498 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN3P07498 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN3P07498 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN3P07498 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN3P07498 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN3P07498 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN3P07498 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSN3P07498 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN3P07498 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN3P07498 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN3P07498 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN3P07498 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN3P07498 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN3P07498 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN3P07498 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN3P07498 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN3P07498 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN3P07498 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN3P07498 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN3P07498 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN3P07498 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN3P07498 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN3P07498 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN3P07498 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN3P07498 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN3P07498 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN3P07498 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN3P07498 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN3P07498 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN3P07498 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN3P07498 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN3P07498 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CSN3P07498 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSN3P07498 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CSN3P07498 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms