Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEFMP07197 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEFMP07197 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEFMP07197 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEFMP07197 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEFMP07197 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEFMP07197 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEFMP07197 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEFMP07197 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEFMP07197 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEFMP07197 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEFMP07197 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEFMP07197 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEFMP07197 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEFMP07197 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEFMP07197 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEFMP07197 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEFMP07197 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEFMP07197 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEFMP07197 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NEFMP07197 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEFMP07197 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEFMP07197 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEFMP07197 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEFMP07197 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEFMP07197 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEFMP07197 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NEFMP07197 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEFMP07197 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NEFMP07197 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEFMP07197 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NEFMP07197 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEFMP07197 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEFMP07197 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NEFMP07197 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEFMP07197 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEFMP07197 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEFMP07197 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEFMP07197 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEFMP07197 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEFMP07197 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEFMP07197 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEFMP07197 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEFMP07197 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEFMP07197 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEFMP07197 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEFMP07197 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEFMP07197 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEFMP07197 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEFMP07197 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEFMP07197 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEFMP07197 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEFMP07197 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEFMP07197 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NEFMP07197 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEFMP07197 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEFMP07197 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEFMP07197 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEFMP07197 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEFMP07197 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEFMP07197 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEFMP07197 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEFMP07197 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEFMP07197 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEFMP07197 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NEFMP07197 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEFMP07197 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEFMP07197 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEFMP07197 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEFMP07197 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEFMP07197 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEFMP07197 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEFMP07197 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEFMP07197 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEFMP07197 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEFMP07197 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEFMP07197 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEFMP07197 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEFMP07197 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEFMP07197 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEFMP07197 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEFMP07197 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEFMP07197 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEFMP07197 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEFMP07197 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEFMP07197 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEFMP07197 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEFMP07197 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEFMP07197 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEFMP07197 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEFMP07197 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEFMP07197 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEFMP07197 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEFMP07197 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEFMP07197 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEFMP07197 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEFMP07197 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEFMP07197 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEFMP07197 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEFMP07197 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms