Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HLA-DOAP06340 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HLA-DOAP06340 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HLA-DOAP06340 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HLA-DOAP06340 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HLA-DOAP06340 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-DOAP06340 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-DOAP06340 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-DOAP06340 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-DOAP06340 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-DOAP06340 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HLA-DOAP06340 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-DOAP06340 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-DOAP06340 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-DOAP06340 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-DOAP06340 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-DOAP06340 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-DOAP06340 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HLA-DOAP06340 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms