Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDN1P05305 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDN1P05305 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDN1P05305 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDN1P05305 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDN1P05305 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDN1P05305 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDN1P05305 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDN1P05305 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EDN1P05305 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EDN1P05305 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDN1P05305 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EDN1P05305 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EDN1P05305 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EDN1P05305 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDN1P05305 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDN1P05305 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDN1P05305 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDN1P05305 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDN1P05305 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EDN1P05305 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDN1P05305 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDN1P05305 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDN1P05305 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDN1P05305 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDN1P05305 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDN1P05305 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDN1P05305 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDN1P05305 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDN1P05305 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDN1P05305 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDN1P05305 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDN1P05305 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDN1P05305 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDN1P05305 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EDN1P05305 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDN1P05305 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDN1P05305 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDN1P05305 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDN1P05305 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDN1P05305 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDN1P05305 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDN1P05305 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDN1P05305 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDN1P05305 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDN1P05305 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDN1P05305 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDN1P05305 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDN1P05305 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDN1P05305 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EDN1P05305 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDN1P05305 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDN1P05305 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDN1P05305 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDN1P05305 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDN1P05305 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDN1P05305 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDN1P05305 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDN1P05305 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDN1P05305 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDN1P05305 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDN1P05305 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDN1P05305 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDN1P05305 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDN1P05305 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EDN1P05305 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDN1P05305 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EDN1P05305 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EDN1P05305 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EDN1P05305 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDN1P05305 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDN1P05305 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDN1P05305 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDN1P05305 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDN1P05305 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDN1P05305 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDN1P05305 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDN1P05305 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDN1P05305 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDN1P05305 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDN1P05305 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDN1P05305 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDN1P05305 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDN1P05305 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDN1P05305 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDN1P05305 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDN1P05305 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDN1P05305 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDN1P05305 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDN1P05305 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDN1P05305 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDN1P05305 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EDN1P05305 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EDN1P05305 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDN1P05305 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDN1P05305 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDN1P05305 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EDN1P05305 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDN1P05305 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EDN1P05305 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms