Protein–RNA interactions for Protein: P02381

VAR1, Ribosomal protein VAR1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 398 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	P02381	BNA1	YJR025C	534 nt		2.87	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	ELO3	YLR372W	1038 nt		2.87	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	FOL3	YMR113W	1284 nt		2.87	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	ASI1	YMR119W	1875 nt		2.87	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	MDL1	YLR188W	2088 nt		2.87	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	THI22	YPR121W	1719 nt		2.87	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	NOG1	YPL093W	1944 nt		2.86	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	AI5_BETA	Q0075	1065 nt		2.86	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	tL(UAG)J	tL(UAG)J	82 nt		2.86	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	tL(UAG)L1	tL(UAG)L1	82 nt		2.86	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	tL(UAG)L2	tL(UAG)L2	82 nt		2.86	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	RAI1	YGL246C	1164 nt		2.86	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	DLS1	YJL065C	504 nt		2.86	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	CDC73	YLR418C	1182 nt		2.86	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	HAL1	YPR005C	885 nt		2.86	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	YPR077C	YPR077C	372 nt		2.86	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	SPN1	YPR133C	1233 nt		2.86	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	SAS10	YDL153C	1833 nt		2.86	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	DAN4	YJR151C	3486 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	TCP1	YDR212W	1680 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	MTR4	YJL050W	3222 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	HMLALPHA1	YCL066W	528 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	MATALPHA1	YCR040W	528 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	BUD16	YEL029C	939 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	OSW1	YOR255W	837 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	YPL168W	YPL168W	1293 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	RRP5	YMR229C	5190 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	TAF1	YGR274C	3201 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	STT4	YLR305C	5703 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	GLO3	YER122C	1482 nt		2.84	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	AIP1	YMR092C	1848 nt		2.84	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	MRPL11	YDL202W	750 nt		2.84	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	DPB4	YDR121W	591 nt		2.84	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	BAT2	YJR148W	1131 nt		2.84	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	COQ5	YML110C	924 nt		2.84	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	TMA108	YIL137C	2841 nt		2.84	□□□□□ -1.95
VAR1	P02381	YPR022C	YPR022C	3402 nt		2.84	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	URA2	YJL130C	6645 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	DHH1	YDL160C	1521 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	YDL180W	YDL180W	1644 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	PPQ1	YPL179W	1650 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	FCF1	YDR339C	570 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	LST7	YGR057C	729 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	OCT1	YKL134C	2319 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	GIS4	YML006C	2325 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	POL2	YNL262W	6669 nt		2.83	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	SLH1	YGR271W	5904 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	ROD1	YOR018W	2514 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	TCB3	YML072C	4638 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	YDL242W	YDL242W	354 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	RPS18A	YDR450W	441 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	YHP1	YDR451C	1062 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	FUR1	YHR128W	651 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	tV(CAC)D	tV(CAC)D	73 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	tV(CAC)H	tV(CAC)H	73 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	PFA4	YOL003C	1137 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	YRB30	YGL164C	1323 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	SPO71	YDR104C	3738 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	DOA4	YDR069C	2781 nt		2.82	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	TRS120	YDR407C	3870 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	BMS1	YPL217C	3552 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	IGO2	YHR132W-A	396 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	YOR238W	YOR238W	912 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	SSM4	YIL030C	3960 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	RTT109	YLL002W	1311 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	SSU1	YPL092W	1377 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	TDA3	YHR009C	1572 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	MUP3	YHL036W	1641 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	SKN7	YHR206W	1869 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	PDR12	YPL058C	4536 nt		2.81	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	ARO1	YDR127W	4767 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	IOC3	YFR013W	2364 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	TMN2	YDR107C	2019 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	SLM2	YNL047C	1971 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	YHI9	YHR029C	885 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	CSM2	YIL132C	642 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	AUR1	YKL004W	1206 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	YPT7	YML001W	627 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	SHH3	YMR118C	591 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	YBL065W	YBL065W	345 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	IST1	YNL265C	897 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	SAS5	YOR213C	747 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	MAK21	YDR060W	3078 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	RDS1	YCR106W	2499 nt		2.8	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	RCY1	YJL204C	2523 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	UBP10	YNL186W	2379 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	TRX3	YCR083W	384 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	UBC8	YEL012W	657 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	LSM1	YJL124C	519 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	PRX1	YBL064C	786 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	YOR008W-B	YOR008W-B	102 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	MNR2	YKL064W	2910 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	MSR1	YHR091C	1932 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	RAD5	YLR032W	3510 nt		2.79	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	SOF1	YLL011W	1470 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	HDA2	YDR295C	2025 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	CDC45	YLR103C	1953 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	RPN1	YHR027C	2982 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	CAF130	YGR134W	3369 nt		2.78	□□□□□ -1.96
VAR1	P02381	FAP7	YDL166C	594 nt		2.78	□□□□□ -1.96

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