Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
IFNA2P01563 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
IFNA2P01563 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms