Protein–RNA interactions for Protein: P01189

POMC, Pro-opiomelanocortin, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMCP01189 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POMCP01189 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POMCP01189 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POMCP01189 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POMCP01189 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POMCP01189 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POMCP01189 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POMCP01189 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POMCP01189 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POMCP01189 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POMCP01189 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POMCP01189 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POMCP01189 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POMCP01189 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POMCP01189 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POMCP01189 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
POMCP01189 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POMCP01189 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POMCP01189 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POMCP01189 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POMCP01189 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POMCP01189 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POMCP01189 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POMCP01189 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POMCP01189 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POMCP01189 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POMCP01189 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POMCP01189 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POMCP01189 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POMCP01189 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POMCP01189 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POMCP01189 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POMCP01189 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POMCP01189 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POMCP01189 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POMCP01189 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POMCP01189 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POMCP01189 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POMCP01189 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POMCP01189 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POMCP01189 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POMCP01189 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POMCP01189 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POMCP01189 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POMCP01189 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POMCP01189 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POMCP01189 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POMCP01189 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POMCP01189 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POMCP01189 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POMCP01189 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POMCP01189 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POMCP01189 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POMCP01189 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POMCP01189 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POMCP01189 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POMCP01189 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POMCP01189 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POMCP01189 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POMCP01189 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POMCP01189 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POMCP01189 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POMCP01189 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POMCP01189 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POMCP01189 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POMCP01189 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POMCP01189 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POMCP01189 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POMCP01189 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POMCP01189 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POMCP01189 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POMCP01189 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POMCP01189 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POMCP01189 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POMCP01189 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POMCP01189 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POMCP01189 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POMCP01189 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POMCP01189 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POMCP01189 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POMCP01189 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POMCP01189 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POMCP01189 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POMCP01189 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POMCP01189 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POMCP01189 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POMCP01189 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POMCP01189 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POMCP01189 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POMCP01189 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POMCP01189 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POMCP01189 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POMCP01189 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POMCP01189 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POMCP01189 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POMCP01189 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POMCP01189 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POMCP01189 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POMCP01189 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POMCP01189 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms