Protein–RNA interactions for Protein: P00450

CP, Ceruloplasmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPP00450 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPP00450 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPP00450 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPP00450 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPP00450 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPP00450 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPP00450 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPP00450 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPP00450 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPP00450 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPP00450 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPP00450 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPP00450 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPP00450 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPP00450 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPP00450 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPP00450 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPP00450 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPP00450 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPP00450 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPP00450 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPP00450 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPP00450 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPP00450 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPP00450 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPP00450 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPP00450 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPP00450 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPP00450 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPP00450 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPP00450 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPP00450 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPP00450 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPP00450 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPP00450 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPP00450 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPP00450 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPP00450 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPP00450 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPP00450 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPP00450 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPP00450 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPP00450 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPP00450 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPP00450 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPP00450 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPP00450 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPP00450 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPP00450 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPP00450 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPP00450 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPP00450 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPP00450 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPP00450 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPP00450 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPP00450 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPP00450 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPP00450 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPP00450 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPP00450 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPP00450 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPP00450 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPP00450 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPP00450 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPP00450 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPP00450 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPP00450 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPP00450 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPP00450 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPP00450 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPP00450 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPP00450 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPP00450 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPP00450 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPP00450 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPP00450 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPP00450 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPP00450 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPP00450 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPP00450 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPP00450 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPP00450 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPP00450 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPP00450 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPP00450 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPP00450 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPP00450 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPP00450 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPP00450 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPP00450 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPP00450 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPP00450 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPP00450 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CPP00450 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPP00450 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPP00450 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPP00450 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPP00450 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPP00450 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPP00450 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms