Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZBED1O96006 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZBED1O96006 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
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