Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD3O95983 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD3O95983 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD3O95983 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD3O95983 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD3O95983 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD3O95983 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD3O95983 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD3O95983 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD3O95983 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD3O95983 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD3O95983 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD3O95983 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD3O95983 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD3O95983 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD3O95983 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD3O95983 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD3O95983 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD3O95983 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD3O95983 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD3O95983 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD3O95983 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD3O95983 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD3O95983 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD3O95983 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD3O95983 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD3O95983 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD3O95983 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD3O95983 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD3O95983 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD3O95983 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD3O95983 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD3O95983 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD3O95983 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD3O95983 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD3O95983 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD3O95983 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD3O95983 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD3O95983 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD3O95983 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD3O95983 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD3O95983 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD3O95983 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD3O95983 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD3O95983 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD3O95983 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD3O95983 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD3O95983 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD3O95983 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD3O95983 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD3O95983 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD3O95983 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD3O95983 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD3O95983 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD3O95983 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD3O95983 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD3O95983 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD3O95983 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD3O95983 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD3O95983 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD3O95983 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD3O95983 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD3O95983 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD3O95983 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD3O95983 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD3O95983 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD3O95983 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD3O95983 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD3O95983 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD3O95983 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD3O95983 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD3O95983 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD3O95983 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD3O95983 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD3O95983 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD3O95983 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD3O95983 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD3O95983 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD3O95983 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD3O95983 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD3O95983 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD3O95983 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD3O95983 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD3O95983 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD3O95983 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD3O95983 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD3O95983 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD3O95983 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD3O95983 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD3O95983 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD3O95983 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD3O95983 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD3O95983 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD3O95983 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD3O95983 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD3O95983 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD3O95983 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD3O95983 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD3O95983 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD3O95983 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms