Protein–RNA interactions for Protein: O95936

EOMES, Eomesodermin homolog, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EOMESO95936 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EOMESO95936 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EOMESO95936 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EOMESO95936 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EOMESO95936 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EOMESO95936 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EOMESO95936 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EOMESO95936 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EOMESO95936 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EOMESO95936 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EOMESO95936 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EOMESO95936 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EOMESO95936 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EOMESO95936 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EOMESO95936 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EOMESO95936 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EOMESO95936 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EOMESO95936 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EOMESO95936 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EOMESO95936 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EOMESO95936 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EOMESO95936 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EOMESO95936 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EOMESO95936 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EOMESO95936 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EOMESO95936 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EOMESO95936 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EOMESO95936 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EOMESO95936 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EOMESO95936 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EOMESO95936 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EOMESO95936 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EOMESO95936 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EOMESO95936 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EOMESO95936 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EOMESO95936 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EOMESO95936 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EOMESO95936 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EOMESO95936 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EOMESO95936 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EOMESO95936 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EOMESO95936 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EOMESO95936 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EOMESO95936 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EOMESO95936 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EOMESO95936 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EOMESO95936 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EOMESO95936 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EOMESO95936 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EOMESO95936 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EOMESO95936 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EOMESO95936 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EOMESO95936 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EOMESO95936 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EOMESO95936 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EOMESO95936 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EOMESO95936 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EOMESO95936 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EOMESO95936 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EOMESO95936 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EOMESO95936 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EOMESO95936 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EOMESO95936 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EOMESO95936 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EOMESO95936 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EOMESO95936 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EOMESO95936 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EOMESO95936 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EOMESO95936 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EOMESO95936 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EOMESO95936 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EOMESO95936 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EOMESO95936 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EOMESO95936 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EOMESO95936 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EOMESO95936 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
EOMESO95936 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EOMESO95936 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EOMESO95936 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EOMESO95936 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EOMESO95936 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EOMESO95936 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EOMESO95936 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EOMESO95936 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EOMESO95936 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EOMESO95936 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EOMESO95936 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EOMESO95936 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EOMESO95936 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EOMESO95936 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EOMESO95936 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EOMESO95936 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EOMESO95936 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EOMESO95936 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EOMESO95936 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EOMESO95936 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EOMESO95936 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EOMESO95936 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EOMESO95936 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EOMESO95936 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms