Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRUB2O95900 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRUB2O95900 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms