Protein–RNA interactions for Protein: O95803

NDST3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST3O95803 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST3O95803 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST3O95803 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST3O95803 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST3O95803 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST3O95803 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST3O95803 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST3O95803 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST3O95803 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST3O95803 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST3O95803 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST3O95803 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST3O95803 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST3O95803 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST3O95803 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST3O95803 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST3O95803 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDST3O95803 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST3O95803 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST3O95803 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST3O95803 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST3O95803 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST3O95803 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST3O95803 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST3O95803 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST3O95803 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST3O95803 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST3O95803 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST3O95803 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST3O95803 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST3O95803 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST3O95803 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST3O95803 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST3O95803 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST3O95803 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDST3O95803 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDST3O95803 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDST3O95803 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDST3O95803 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDST3O95803 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDST3O95803 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDST3O95803 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDST3O95803 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDST3O95803 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDST3O95803 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST3O95803 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST3O95803 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST3O95803 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST3O95803 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST3O95803 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST3O95803 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST3O95803 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST3O95803 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST3O95803 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST3O95803 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST3O95803 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST3O95803 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST3O95803 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDST3O95803 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDST3O95803 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDST3O95803 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDST3O95803 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDST3O95803 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDST3O95803 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NDST3O95803 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NDST3O95803 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDST3O95803 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDST3O95803 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDST3O95803 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDST3O95803 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDST3O95803 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDST3O95803 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDST3O95803 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDST3O95803 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDST3O95803 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDST3O95803 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDST3O95803 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDST3O95803 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDST3O95803 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDST3O95803 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDST3O95803 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDST3O95803 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NDST3O95803 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST3O95803 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST3O95803 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST3O95803 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST3O95803 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST3O95803 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST3O95803 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST3O95803 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST3O95803 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST3O95803 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST3O95803 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST3O95803 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDST3O95803 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDST3O95803 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDST3O95803 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NDST3O95803 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDST3O95803 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NDST3O95803 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms