Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX58O95786 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX58O95786 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX58O95786 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX58O95786 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX58O95786 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX58O95786 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX58O95786 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX58O95786 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX58O95786 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX58O95786 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX58O95786 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX58O95786 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX58O95786 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX58O95786 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX58O95786 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX58O95786 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX58O95786 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX58O95786 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX58O95786 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX58O95786 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX58O95786 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX58O95786 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX58O95786 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX58O95786 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX58O95786 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX58O95786 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX58O95786 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX58O95786 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX58O95786 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX58O95786 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX58O95786 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX58O95786 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX58O95786 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX58O95786 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX58O95786 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX58O95786 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX58O95786 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX58O95786 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX58O95786 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX58O95786 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX58O95786 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX58O95786 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX58O95786 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX58O95786 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX58O95786 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX58O95786 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX58O95786 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX58O95786 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX58O95786 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX58O95786 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX58O95786 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX58O95786 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX58O95786 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX58O95786 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX58O95786 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX58O95786 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX58O95786 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX58O95786 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX58O95786 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX58O95786 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX58O95786 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DDX58O95786 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX58O95786 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX58O95786 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX58O95786 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX58O95786 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX58O95786 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX58O95786 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX58O95786 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX58O95786 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX58O95786 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX58O95786 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX58O95786 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX58O95786 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX58O95786 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX58O95786 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX58O95786 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX58O95786 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
DDX58O95786 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX58O95786 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX58O95786 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX58O95786 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX58O95786 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX58O95786 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DDX58O95786 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX58O95786 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX58O95786 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX58O95786 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX58O95786 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX58O95786 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX58O95786 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DDX58O95786 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX58O95786 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX58O95786 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX58O95786 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX58O95786 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX58O95786 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX58O95786 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX58O95786 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms