Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SFT2D2O95562 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFT2D2O95562 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms