Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBE4BO95155 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBE4BO95155 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms