Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG12O94817 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG12O94817 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG12O94817 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG12O94817 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG12O94817 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG12O94817 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG12O94817 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG12O94817 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG12O94817 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG12O94817 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG12O94817 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG12O94817 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG12O94817 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG12O94817 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG12O94817 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG12O94817 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG12O94817 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG12O94817 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG12O94817 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG12O94817 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG12O94817 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG12O94817 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG12O94817 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG12O94817 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG12O94817 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG12O94817 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG12O94817 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG12O94817 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG12O94817 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG12O94817 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG12O94817 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG12O94817 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG12O94817 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG12O94817 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG12O94817 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG12O94817 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG12O94817 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG12O94817 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG12O94817 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG12O94817 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG12O94817 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG12O94817 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG12O94817 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG12O94817 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG12O94817 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG12O94817 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG12O94817 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG12O94817 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG12O94817 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG12O94817 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG12O94817 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG12O94817 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG12O94817 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG12O94817 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG12O94817 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG12O94817 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG12O94817 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG12O94817 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG12O94817 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG12O94817 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG12O94817 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG12O94817 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG12O94817 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATG12O94817 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG12O94817 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG12O94817 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG12O94817 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG12O94817 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG12O94817 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG12O94817 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG12O94817 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG12O94817 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATG12O94817 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG12O94817 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG12O94817 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG12O94817 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG12O94817 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG12O94817 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG12O94817 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG12O94817 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG12O94817 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG12O94817 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG12O94817 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG12O94817 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATG12O94817 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG12O94817 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG12O94817 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG12O94817 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG12O94817 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG12O94817 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG12O94817 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG12O94817 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG12O94817 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG12O94817 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG12O94817 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG12O94817 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG12O94817 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG12O94817 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG12O94817 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms