Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BBOX1O75936 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BBOX1O75936 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BBOX1O75936 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms