Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
DCTN3O75935 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DCTN3O75935 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms