Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP3O75386 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP3O75386 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP3O75386 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP3O75386 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP3O75386 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP3O75386 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP3O75386 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP3O75386 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TULP3O75386 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TULP3O75386 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TULP3O75386 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP3O75386 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP3O75386 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP3O75386 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP3O75386 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP3O75386 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP3O75386 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP3O75386 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP3O75386 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP3O75386 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP3O75386 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP3O75386 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP3O75386 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP3O75386 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP3O75386 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP3O75386 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP3O75386 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP3O75386 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP3O75386 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP3O75386 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP3O75386 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP3O75386 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP3O75386 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP3O75386 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP3O75386 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP3O75386 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP3O75386 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP3O75386 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP3O75386 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP3O75386 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP3O75386 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP3O75386 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP3O75386 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP3O75386 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP3O75386 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP3O75386 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP3O75386 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP3O75386 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP3O75386 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP3O75386 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP3O75386 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP3O75386 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP3O75386 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP3O75386 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP3O75386 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP3O75386 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP3O75386 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP3O75386 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TULP3O75386 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TULP3O75386 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TULP3O75386 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TULP3O75386 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TULP3O75386 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TULP3O75386 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TULP3O75386 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TULP3O75386 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP3O75386 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP3O75386 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP3O75386 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP3O75386 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP3O75386 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP3O75386 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP3O75386 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP3O75386 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP3O75386 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP3O75386 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TULP3O75386 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TULP3O75386 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP3O75386 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP3O75386 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP3O75386 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP3O75386 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP3O75386 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP3O75386 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP3O75386 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP3O75386 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP3O75386 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP3O75386 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP3O75386 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP3O75386 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP3O75386 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TULP3O75386 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP3O75386 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP3O75386 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP3O75386 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP3O75386 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP3O75386 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP3O75386 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TULP3O75386 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms