Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG13O75143 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG13O75143 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG13O75143 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG13O75143 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG13O75143 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG13O75143 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG13O75143 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG13O75143 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG13O75143 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG13O75143 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG13O75143 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG13O75143 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG13O75143 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG13O75143 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG13O75143 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG13O75143 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG13O75143 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG13O75143 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG13O75143 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG13O75143 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG13O75143 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG13O75143 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG13O75143 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG13O75143 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG13O75143 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG13O75143 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG13O75143 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG13O75143 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG13O75143 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG13O75143 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG13O75143 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG13O75143 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG13O75143 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG13O75143 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG13O75143 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG13O75143 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG13O75143 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG13O75143 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG13O75143 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG13O75143 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG13O75143 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG13O75143 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG13O75143 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG13O75143 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG13O75143 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG13O75143 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG13O75143 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG13O75143 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG13O75143 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG13O75143 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG13O75143 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG13O75143 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG13O75143 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG13O75143 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG13O75143 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG13O75143 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG13O75143 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATG13O75143 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG13O75143 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG13O75143 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG13O75143 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG13O75143 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG13O75143 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG13O75143 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG13O75143 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG13O75143 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG13O75143 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG13O75143 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG13O75143 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG13O75143 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG13O75143 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG13O75143 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG13O75143 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG13O75143 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG13O75143 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG13O75143 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG13O75143 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG13O75143 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG13O75143 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG13O75143 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG13O75143 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG13O75143 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG13O75143 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG13O75143 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG13O75143 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG13O75143 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG13O75143 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG13O75143 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG13O75143 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG13O75143 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG13O75143 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG13O75143 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG13O75143 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG13O75143 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG13O75143 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG13O75143 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG13O75143 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG13O75143 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG13O75143 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms