Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTSVO60911 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTSVO60911 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CTSVO60911 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTSVO60911 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTSVO60911 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTSVO60911 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTSVO60911 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTSVO60911 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTSVO60911 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTSVO60911 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTSVO60911 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTSVO60911 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTSVO60911 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTSVO60911 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTSVO60911 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTSVO60911 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTSVO60911 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTSVO60911 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTSVO60911 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTSVO60911 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTSVO60911 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTSVO60911 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTSVO60911 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTSVO60911 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTSVO60911 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTSVO60911 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTSVO60911 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTSVO60911 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTSVO60911 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTSVO60911 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTSVO60911 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTSVO60911 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTSVO60911 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTSVO60911 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTSVO60911 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTSVO60911 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTSVO60911 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTSVO60911 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTSVO60911 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTSVO60911 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTSVO60911 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTSVO60911 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CTSVO60911 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTSVO60911 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CTSVO60911 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTSVO60911 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTSVO60911 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTSVO60911 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTSVO60911 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTSVO60911 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTSVO60911 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTSVO60911 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTSVO60911 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTSVO60911 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTSVO60911 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTSVO60911 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CTSVO60911 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTSVO60911 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTSVO60911 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTSVO60911 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CTSVO60911 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTSVO60911 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTSVO60911 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CTSVO60911 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTSVO60911 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTSVO60911 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CTSVO60911 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CTSVO60911 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTSVO60911 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTSVO60911 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTSVO60911 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTSVO60911 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTSVO60911 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTSVO60911 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CTSVO60911 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTSVO60911 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTSVO60911 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTSVO60911 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTSVO60911 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTSVO60911 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTSVO60911 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTSVO60911 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTSVO60911 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTSVO60911 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTSVO60911 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTSVO60911 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CTSVO60911 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTSVO60911 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTSVO60911 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTSVO60911 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTSVO60911 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTSVO60911 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTSVO60911 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTSVO60911 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTSVO60911 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTSVO60911 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTSVO60911 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTSVO60911 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTSVO60911 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms