Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC22O60826 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC22O60826 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms