Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
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PRAMEF10O60809 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAMEF10O60809 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.32■■□□□ 1
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PRAMEF10O60809 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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PRAMEF10O60809 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
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PRAMEF10O60809 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
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PRAMEF10O60809 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAMEF10O60809 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
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