Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXD2O60548 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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