Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUSD5O60279 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SUSD5O60279 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SUSD5O60279 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SUSD5O60279 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SUSD5O60279 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SUSD5O60279 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SUSD5O60279 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SUSD5O60279 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SUSD5O60279 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SUSD5O60279 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SUSD5O60279 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SUSD5O60279 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms