Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PLIN1O60240 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLIN1O60240 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PLIN1O60240 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms