Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DHX16O60231 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DHX16O60231 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DHX16O60231 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
DHX16O60231 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
DHX16O60231 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
DHX16O60231 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DHX16O60231 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DHX16O60231 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DHX16O60231 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DHX16O60231 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DHX16O60231 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DHX16O60231 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DHX16O60231 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DHX16O60231 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DHX16O60231 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DHX16O60231 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DHX16O60231 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DHX16O60231 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DHX16O60231 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DHX16O60231 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DHX16O60231 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DHX16O60231 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DHX16O60231 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DHX16O60231 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DHX16O60231 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DHX16O60231 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DHX16O60231 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DHX16O60231 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DHX16O60231 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DHX16O60231 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DHX16O60231 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DHX16O60231 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DHX16O60231 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DHX16O60231 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DHX16O60231 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DHX16O60231 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DHX16O60231 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DHX16O60231 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DHX16O60231 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DHX16O60231 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DHX16O60231 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DHX16O60231 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DHX16O60231 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DHX16O60231 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DHX16O60231 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DHX16O60231 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DHX16O60231 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DHX16O60231 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DHX16O60231 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DHX16O60231 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DHX16O60231 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DHX16O60231 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DHX16O60231 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DHX16O60231 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DHX16O60231 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DHX16O60231 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DHX16O60231 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DHX16O60231 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DHX16O60231 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DHX16O60231 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DHX16O60231 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DHX16O60231 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DHX16O60231 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DHX16O60231 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DHX16O60231 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DHX16O60231 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DHX16O60231 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DHX16O60231 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DHX16O60231 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DHX16O60231 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DHX16O60231 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DHX16O60231 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DHX16O60231 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DHX16O60231 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DHX16O60231 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DHX16O60231 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DHX16O60231 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DHX16O60231 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DHX16O60231 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
DHX16O60231 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DHX16O60231 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DHX16O60231 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DHX16O60231 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DHX16O60231 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DHX16O60231 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DHX16O60231 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DHX16O60231 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DHX16O60231 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DHX16O60231 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DHX16O60231 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DHX16O60231 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DHX16O60231 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DHX16O60231 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DHX16O60231 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DHX16O60231 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DHX16O60231 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DHX16O60231 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DHX16O60231 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DHX16O60231 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms