Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PDE6DO43924 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6DO43924 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms