Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms