Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SYNGR2O43760 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SYNGR2O43760 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms