Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIPK2O43353 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RIPK2O43353 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RIPK2O43353 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms