Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTIFO43310 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTIFO43310 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTIFO43310 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTIFO43310 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTIFO43310 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTIFO43310 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTIFO43310 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTIFO43310 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTIFO43310 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTIFO43310 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTIFO43310 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTIFO43310 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTIFO43310 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTIFO43310 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTIFO43310 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTIFO43310 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTIFO43310 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTIFO43310 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTIFO43310 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTIFO43310 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTIFO43310 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTIFO43310 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTIFO43310 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CTIFO43310 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTIFO43310 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTIFO43310 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTIFO43310 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTIFO43310 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTIFO43310 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CTIFO43310 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTIFO43310 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTIFO43310 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTIFO43310 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTIFO43310 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTIFO43310 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTIFO43310 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTIFO43310 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTIFO43310 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTIFO43310 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTIFO43310 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTIFO43310 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTIFO43310 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTIFO43310 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTIFO43310 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTIFO43310 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTIFO43310 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTIFO43310 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTIFO43310 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTIFO43310 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTIFO43310 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTIFO43310 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTIFO43310 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTIFO43310 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTIFO43310 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTIFO43310 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTIFO43310 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTIFO43310 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTIFO43310 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTIFO43310 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTIFO43310 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTIFO43310 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTIFO43310 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTIFO43310 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTIFO43310 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTIFO43310 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTIFO43310 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTIFO43310 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTIFO43310 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTIFO43310 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTIFO43310 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTIFO43310 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTIFO43310 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CTIFO43310 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTIFO43310 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTIFO43310 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTIFO43310 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTIFO43310 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTIFO43310 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CTIFO43310 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTIFO43310 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTIFO43310 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTIFO43310 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTIFO43310 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTIFO43310 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTIFO43310 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTIFO43310 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTIFO43310 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTIFO43310 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTIFO43310 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTIFO43310 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTIFO43310 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTIFO43310 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTIFO43310 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTIFO43310 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTIFO43310 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTIFO43310 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTIFO43310 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTIFO43310 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTIFO43310 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
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