Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.762e-7■■■■□ 24.6
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PRPF4O43172 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.892e-7■■■■□ 24.6
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PRPF4O43172 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.192e-14■■■■□ 24.3
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PRPF4O43172 NAP1L1-215ENST00000549479 573 ntTSL 210.57□□□□□ -0.722e-14■■■■□ 24.3
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