Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SYNJ2O15056 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SYNJ2O15056 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.37
SYNJ2O15056 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SYNJ2O15056 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SYNJ2O15056 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SYNJ2O15056 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYNJ2O15056 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYNJ2O15056 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYNJ2O15056 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYNJ2O15056 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYNJ2O15056 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SYNJ2O15056 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SYNJ2O15056 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms