Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PODXLO00592 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PODXLO00592 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PODXLO00592 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PODXLO00592 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PODXLO00592 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PODXLO00592 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PODXLO00592 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PODXLO00592 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PODXLO00592 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PODXLO00592 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PODXLO00592 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PODXLO00592 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PODXLO00592 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PODXLO00592 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PODXLO00592 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PODXLO00592 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PODXLO00592 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PODXLO00592 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PODXLO00592 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PODXLO00592 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PODXLO00592 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PODXLO00592 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PODXLO00592 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PODXLO00592 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PODXLO00592 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PODXLO00592 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PODXLO00592 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PODXLO00592 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PODXLO00592 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PODXLO00592 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PODXLO00592 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PODXLO00592 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PODXLO00592 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PODXLO00592 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PODXLO00592 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PODXLO00592 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PODXLO00592 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PODXLO00592 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PODXLO00592 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PODXLO00592 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PODXLO00592 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PODXLO00592 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PODXLO00592 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PODXLO00592 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PODXLO00592 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PODXLO00592 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PODXLO00592 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PODXLO00592 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PODXLO00592 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PODXLO00592 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PODXLO00592 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PODXLO00592 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PODXLO00592 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PODXLO00592 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PODXLO00592 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PODXLO00592 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PODXLO00592 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PODXLO00592 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PODXLO00592 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PODXLO00592 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PODXLO00592 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PODXLO00592 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PODXLO00592 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXLO00592 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXLO00592 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXLO00592 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXLO00592 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXLO00592 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXLO00592 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXLO00592 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXLO00592 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXLO00592 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXLO00592 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXLO00592 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PODXLO00592 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXLO00592 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXLO00592 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXLO00592 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXLO00592 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXLO00592 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXLO00592 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXLO00592 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXLO00592 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXLO00592 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXLO00592 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXLO00592 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXLO00592 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXLO00592 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXLO00592 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXLO00592 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXLO00592 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PODXLO00592 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXLO00592 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXLO00592 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXLO00592 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXLO00592 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXLO00592 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXLO00592 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PODXLO00592 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms