Protein–RNA interactions for Protein: O00567

NOP56, Nucleolar protein 56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56O00567 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOP56O00567 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOP56O00567 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOP56O00567 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOP56O00567 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NOP56O00567 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOP56O00567 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOP56O00567 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOP56O00567 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOP56O00567 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOP56O00567 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOP56O00567 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOP56O00567 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOP56O00567 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOP56O00567 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOP56O00567 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOP56O00567 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOP56O00567 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOP56O00567 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOP56O00567 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOP56O00567 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOP56O00567 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOP56O00567 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOP56O00567 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NOP56O00567 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOP56O00567 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NOP56O00567 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NOP56O00567 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOP56O00567 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOP56O00567 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOP56O00567 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOP56O00567 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOP56O00567 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOP56O00567 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOP56O00567 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOP56O00567 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOP56O00567 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOP56O00567 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOP56O00567 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOP56O00567 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOP56O00567 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOP56O00567 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOP56O00567 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOP56O00567 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOP56O00567 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOP56O00567 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOP56O00567 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOP56O00567 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOP56O00567 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOP56O00567 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOP56O00567 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOP56O00567 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOP56O00567 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOP56O00567 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOP56O00567 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOP56O00567 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NOP56O00567 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOP56O00567 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOP56O00567 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOP56O00567 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOP56O00567 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOP56O00567 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOP56O00567 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOP56O00567 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOP56O00567 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOP56O00567 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOP56O00567 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOP56O00567 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOP56O00567 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOP56O00567 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOP56O00567 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOP56O00567 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOP56O00567 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOP56O00567 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NOP56O00567 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOP56O00567 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOP56O00567 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NOP56O00567 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOP56O00567 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOP56O00567 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOP56O00567 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOP56O00567 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOP56O00567 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOP56O00567 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOP56O00567 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOP56O00567 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOP56O00567 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOP56O00567 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOP56O00567 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOP56O00567 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOP56O00567 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOP56O00567 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NOP56O00567 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NOP56O00567 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOP56O00567 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOP56O00567 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOP56O00567 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOP56O00567 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOP56O00567 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOP56O00567 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms