Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KPNA3O00505 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KPNA3O00505 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms