Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ELL2O00472 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ELL2O00472 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ELL2O00472 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ELL2O00472 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ELL2O00472 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ELL2O00472 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ELL2O00472 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ELL2O00472 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ELL2O00472 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ELL2O00472 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ELL2O00472 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ELL2O00472 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ELL2O00472 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ELL2O00472 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ELL2O00472 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ELL2O00472 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ELL2O00472 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ELL2O00472 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ELL2O00472 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ELL2O00472 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ELL2O00472 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ELL2O00472 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ELL2O00472 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ELL2O00472 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ELL2O00472 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ELL2O00472 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ELL2O00472 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ELL2O00472 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ELL2O00472 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ELL2O00472 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ELL2O00472 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ELL2O00472 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ELL2O00472 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ELL2O00472 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ELL2O00472 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ELL2O00472 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ELL2O00472 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ELL2O00472 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELL2O00472 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELL2O00472 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELL2O00472 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELL2O00472 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELL2O00472 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELL2O00472 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELL2O00472 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELL2O00472 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELL2O00472 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELL2O00472 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELL2O00472 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELL2O00472 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELL2O00472 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ELL2O00472 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELL2O00472 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELL2O00472 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELL2O00472 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELL2O00472 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ELL2O00472 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ELL2O00472 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ELL2O00472 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ELL2O00472 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ELL2O00472 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ELL2O00472 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ELL2O00472 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ELL2O00472 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ELL2O00472 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ELL2O00472 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ELL2O00472 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ELL2O00472 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ELL2O00472 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ELL2O00472 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ELL2O00472 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ELL2O00472 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ELL2O00472 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ELL2O00472 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ELL2O00472 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ELL2O00472 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ELL2O00472 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ELL2O00472 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ELL2O00472 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ELL2O00472 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ELL2O00472 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ELL2O00472 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ELL2O00472 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ELL2O00472 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ELL2O00472 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ELL2O00472 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ELL2O00472 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ELL2O00472 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ELL2O00472 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ELL2O00472 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ELL2O00472 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ELL2O00472 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ELL2O00472 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ELL2O00472 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ELL2O00472 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ELL2O00472 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ELL2O00472 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ELL2O00472 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ELL2O00472 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms