Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGRNO00468 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGRNO00468 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGRNO00468 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGRNO00468 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGRNO00468 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGRNO00468 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGRNO00468 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGRNO00468 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGRNO00468 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGRNO00468 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGRNO00468 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGRNO00468 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGRNO00468 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGRNO00468 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGRNO00468 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGRNO00468 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGRNO00468 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGRNO00468 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGRNO00468 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGRNO00468 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGRNO00468 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGRNO00468 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGRNO00468 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGRNO00468 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGRNO00468 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGRNO00468 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGRNO00468 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGRNO00468 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGRNO00468 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGRNO00468 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
AGRNO00468 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGRNO00468 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGRNO00468 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGRNO00468 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGRNO00468 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGRNO00468 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGRNO00468 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGRNO00468 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGRNO00468 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGRNO00468 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGRNO00468 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGRNO00468 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGRNO00468 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGRNO00468 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AGRNO00468 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AGRNO00468 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AGRNO00468 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGRNO00468 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGRNO00468 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGRNO00468 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGRNO00468 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGRNO00468 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGRNO00468 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGRNO00468 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGRNO00468 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGRNO00468 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGRNO00468 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGRNO00468 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGRNO00468 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
AGRNO00468 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGRNO00468 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGRNO00468 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGRNO00468 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGRNO00468 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGRNO00468 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGRNO00468 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGRNO00468 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
AGRNO00468 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AGRNO00468 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AGRNO00468 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AGRNO00468 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AGRNO00468 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AGRNO00468 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AGRNO00468 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
AGRNO00468 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
AGRNO00468 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGRNO00468 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGRNO00468 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGRNO00468 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGRNO00468 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGRNO00468 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGRNO00468 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGRNO00468 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGRNO00468 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AGRNO00468 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGRNO00468 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AGRNO00468 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AGRNO00468 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AGRNO00468 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AGRNO00468 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
AGRNO00468 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
AGRNO00468 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AGRNO00468 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AGRNO00468 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AGRNO00468 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AGRNO00468 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
AGRNO00468 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AGRNO00468 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
AGRNO00468 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms