Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGPSO00116 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AGPSO00116 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGPSO00116 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGPSO00116 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGPSO00116 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGPSO00116 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGPSO00116 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AGPSO00116 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGPSO00116 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AGPSO00116 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGPSO00116 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGPSO00116 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGPSO00116 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGPSO00116 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGPSO00116 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGPSO00116 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGPSO00116 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGPSO00116 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGPSO00116 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGPSO00116 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGPSO00116 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGPSO00116 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGPSO00116 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGPSO00116 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGPSO00116 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGPSO00116 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGPSO00116 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGPSO00116 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGPSO00116 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AGPSO00116 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGPSO00116 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGPSO00116 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGPSO00116 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGPSO00116 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGPSO00116 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGPSO00116 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGPSO00116 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGPSO00116 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGPSO00116 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGPSO00116 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGPSO00116 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGPSO00116 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGPSO00116 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AGPSO00116 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGPSO00116 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGPSO00116 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGPSO00116 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGPSO00116 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGPSO00116 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGPSO00116 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGPSO00116 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGPSO00116 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGPSO00116 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGPSO00116 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGPSO00116 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AGPSO00116 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGPSO00116 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGPSO00116 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGPSO00116 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGPSO00116 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGPSO00116 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGPSO00116 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGPSO00116 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGPSO00116 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGPSO00116 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGPSO00116 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGPSO00116 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGPSO00116 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGPSO00116 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGPSO00116 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGPSO00116 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGPSO00116 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGPSO00116 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AGPSO00116 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGPSO00116 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGPSO00116 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGPSO00116 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
AGPSO00116 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
AGPSO00116 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGPSO00116 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AGPSO00116 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGPSO00116 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGPSO00116 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGPSO00116 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AGPSO00116 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AGPSO00116 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGPSO00116 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGPSO00116 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGPSO00116 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGPSO00116 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGPSO00116 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGPSO00116 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGPSO00116 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGPSO00116 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGPSO00116 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGPSO00116 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGPSO00116 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGPSO00116 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGPSO00116 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms