Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3QKU1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
J3QKU1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
J3QKU1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3QKU1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3QKU1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3QKU1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3QKU1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
J3QKU1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3QKU1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3QKU1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3QKU1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3QKU1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3QKU1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3QKU1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3QKU1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3QKU1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3QKU1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3QKU1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
J3QKU1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
J3QKU1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3QKU1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3QKU1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3QKU1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3QKU1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3QKU1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3QKU1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3QKU1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3QKU1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
J3QKU1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3QKU1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3QKU1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QKU1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QKU1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QKU1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QKU1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QKU1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QKU1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QKU1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QKU1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QKU1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QKU1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QKU1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QKU1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QKU1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QKU1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QKU1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
J3QKU1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3QKU1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3QKU1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3QKU1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3QKU1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3QKU1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3QKU1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3QKU1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
J3QKU1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3QKU1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
J3QKU1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QKU1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QKU1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QKU1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QKU1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QKU1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QKU1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QKU1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QKU1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QKU1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QKU1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QKU1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QKU1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QKU1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QKU1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QKU1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QKU1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QKU1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
J3QKU1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QKU1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QKU1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QKU1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QKU1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QKU1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QKU1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QKU1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QKU1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QKU1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QKU1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QKU1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QKU1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QKU1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QKU1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QKU1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QKU1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QKU1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
J3QKU1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3QKU1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3QKU1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3QKU1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3QKU1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3QKU1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
J3QKU1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms